日本でモンゴル関係の蔵書が豊富なのは、主に言語学、地域研究、文化人類学、歴史などの分野でモンゴル研究が盛んな大学、研究機関の図書館だが、この他にも見逃せないのは仏教系の大学図書館だ。
大正大学 附属図書館
http://www.tais.ac.jp/lib/index.html
仏教関係の蔵書はもちろんのこと、特に満蒙関係の資料などのモンゴル史の文献も充実している。なお、まだデータベース化が完了していないモンゴル関係の貴重書も収蔵されている。
佛教大学図書館
http://www.bukkyo-u.ac.jp/lib/
モンゴル語訳の『入菩提行論』など、モンゴル語関係の蔵書が充実している。
国際仏教学大学院大学 附属図書館
http://www.icabs.ac.jp/lib/index.html
『蒙古語訳甘殊爾』をはじめ、内モンゴルで出版されたモンゴル関係の書籍が数多く揃っている。昭和初期のモンゴル語教科書、辞書なども含まれており、中には他の図書館ではめったにお目にかかれないような蔵書もある。
駒沢大学図書館
http://www.komazawa-u.ac.jp/cms/library/
内モンゴルで出版されたモンゴル関係の書籍が充実している。また、出版年は不明だが和装本の『蒙古篆字』という珍しい書物も所蔵されている。邦書もモンゴル関係の書物はかなり揃えがいい。
龍谷大学
http://opac.lib.ryukoku.ac.jp/hp/index.html
モンゴル史関係の蔵書が充実している。